签协议只签字不按手印对方不承认的办法是向法院提起诉讼，申请笔记鉴定。协议书格式写法应当写明标题、双方当事人的个人基本信息、签订协议书的目的等。
一、签协议只签字不按手印对方不承认怎么办
签协议只签字不按手印对方不承认的办法是：可以依据有对方签字的材料提起诉讼，对方不承认是本人签字的，应提出笔迹鉴定确认字迹。不进行鉴定的，只是口头不承认没有意义。法律规定，当事人采用合同书形式订立合同的，自双方当事人签字或者盖章时合同成立。
《中华人民共和国民法典》 第四百九十条
当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。
法律、行政法规规定或者当事人约定合同应当采用书面形式订立，当事人未采用书面形式但是一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。
二、协议书格式写法
协议书的格式和写法一般由标题、立约单位、正文、落款四部分组成。
1.标题协议书的标题和合同的标题写法相同，即内容文种。
2.立约单位当事人的名称或姓名及地址(写法和合同相似)
3.正文正文由缘由和主体组成。缘由写明签订协议书的目的、依据等内容。主体分条列项写出协议的事项。
三、协议和合同的区别
协议和合同的区别是：合同的特点是明确、详细、具体，并规定有违约责任；而协议的特点是没有具体标的、简单、概括、原则上不涉及违约责任。对于协议和合同要从其内容、特点等方面进行区分
根据《民法典》第四百六十四条规定，合同是民事主体之间设立、变更、终止民事法律关系的协议
婚姻、收养、监护等有关身份关系的协议，适用有关该身份关系的法律规定；没有规定的，可以根据其性质参照适用本编规定