蛋白质相互作用(protein-protein interactions, ppis)和翻译后修饰(post-translational modifications, ptms)的数据是能显著提高基础类研究文章档次的*内容。
筛选和发现目的蛋白(target)在细胞中新的互作蛋白或者新的后修饰,免疫沉淀(ip,immunoprecipitation)结合lc-ms(液相色谱-质谱连用,蛋白质组学研究的核心工具)是目前的主流技术方案(ip-ms)。
通过一次ip-ms实验,能高通量的鉴定和筛选到多个与要研究的目的蛋白(target)存在相互作用的蛋白质(蛋白质复合物组分),从而拥有属于自己的专属蛋白质相互作用数据库,通过深入的生物学功能与分子机制的分析,能发表多篇连续性的学术文章。
整体服务方案:
客户只需提供基因名称和细胞株即可,我方负责完成后续所有实验,包括:
基因克隆与慢病毒制备。
稳定细胞株构建与鉴定。
细胞扩增培养。
ip纯化蛋白质复合物并sds-page分离。
切割差异条带,lc-ms测试分析。
ms数据分析,挑选潜在的候选验证蛋白(6个)。
购买抗体,进行ip结合western blot验证。承诺6个验证蛋白,至少给出1个阳性的互作。
三、合作共赢方案:
原则是通过协商签订合同,双方各完成一部分实验内容,从而降低相应的服务费用。
客户发表的代表性文章:
clin cancer res, 2014. 20(17): p. 4689-704. (if=8.72).
j proteome res, 2013.12(6): p. 2511-24.
amino acids, 2014.46(4): p. 841-52.