分子蒸馏的基本条件：
1、残余气体的分压须很低，使残余气体的平均自由程长度是蒸发器和冷凝器表面之间距离的倍数。
2、在饱和压力下，蒸汽分子的平均自由程长度必须与蒸发器和冷凝器表面之间距离具有相同的数量级。
在这些理想的条件下，蒸发在没有任何障碍的情况下从残余气体分子中发生。所有蒸汽分子在没有遇到其它分子和返回到液体过程中到达冷凝器表面。蒸发速度在所处的温度下达到可能的zui大值。蒸发速度与压力成正比，因而，分子蒸馏的馏出液量相对比较小。
在短程蒸发器中，冷凝器和加热表面之间的距离约为20—250mm取决于设备的尺寸。残余气体的压力约l0-3mbar时，残余气体分子的平均自由程长度约为2倍长。短短蒸发器能满足分子蒸馏的所有必要条件。