在法院办理协议离婚一般指的是，法院通过调解的方式让夫妻双方协商解决离婚问题，在双方都同意离婚的基础上，双方就孩子抚养和债权债务、财产分割等问题达成一致意见，法院出具民事调解书，经依法签收后，具有法律强制力，对案件不再审理。在法院办理协议离婚是怎么回事的法律依据
《民法典》第一千零七十九条夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：（一）重婚或者与他人同居；（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；（四）因感情不和分居满二年；（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。