大多数微生物在生命活动过程中都需要空气，按照各种微生物对氧的要求不同，可将它们分成如下三类：
1）好气性微生物也称为好氧性微生物，这类微生物在生活中需要氧，只有在氧分子存在的条件下，它们才能正常生活。大多数微生物都属于这一类型，如根霉、曲霉等。在制造压榨酵母时通风可以増加酵母的产量。微生物深层培养时，通入空气不但影晌微生物的生长，还影响微生物的代谢产物，如在抗生素、液体曲、有机酸的生产过程中通风量对产品的产量有很大的影响。
2）厌氧微生物也称专性嫌气微生物。这类微生物不需要分子态氧，分子态氧对它们有毒害作用。如丙酮-丁醇菌及其他梭状芽孢杆菌（如窖泥中能产生己酸的细菌），只能在无氧或缺少氧的状态下生活。
3）兼性嫌气性微生物有相当多的微生物既能在有氧条件下生长，又能在无氧条件下生活。如酵母在有氧条件下迅速生长繁殖，产生大量菌体，在无氧条件下，则进行发酵，产生大量的酒精。在实验室培养好气性或兼性嫌气性微生物，若用固体培养基，则通过棉塞的少量空气即可满足；若用液体培养基，就需在摇床上培养。而对厌氧性微生物的培养，可以用抽真空、焦性没食子酸吸收、覆盖无菌石蜡等方法。