该技术利用气相色谱的分离能力，将混合物中的组分分离，通过接口进入到高真空状态的质谱仪中，其中，接口是液质联用系统的关键，它可以保证色谱和质谱两个系统的压力匹配；然后通过离子源的作用使样品成为离子，电离室中产生的离子在质量分析器中按照荷质比（m/z）大小被分开，进行质谱检测，随后不同荷质比的离子到达检测器，离子束信号转变为电信号，并将信号放大，当离子撞击到检测器时引起倍增器电极表面喷射出一些电子，被喷射出的电子由于电位差被加速射向第二个倍增器电极，喷射出更多的电子，由此连续作用，每个电子碰撞下一个电极时能喷射出2-3个电子，通常电子倍增器有14级倍增器电极，可大大提高检测灵敏度。最后获得质谱图--带正电荷的离子碎片质荷比与其相对强度之间关系的棒图，质谱图中峰称为基峰，其强度规定为99%，其它峰以此峰为基准，确定其相对强度。