当杀菌锅设备的水温或者是水位等产生错误的时候，其可能会因为排水系统的故障而导致设备产生问题。
出现密封圈老化或破损等问题的时候往往也会使得杀菌锅设备产生泄露等问题。所以当设备在运行时出现密封圈老化或破损的情况时，需要在保证设备所拥有的温度、压力等较为稳定的前提条件下对设备进行停机，并更换杀菌锅来继续进杀菌操作。
当设备内的冷却水不足或冷却水吸热时，会使得设备冷却时的效果较差，从而无法达到冷却的效果。所以在使用杀菌锅设备的时候一般需要简单的对其进行检查，防止出现零部件损坏、漏气等问题。
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