一、合同中补充协议有效吗
合同中补充协议有效。
补充协议是对主合同的一个补救措施，是关于合同中约定不明确的内容的补充说明，如果主合同是有效，补充内容符合法律规定时，补充合协议就是有效的。但是补充合同不会随着主合同的无效而无效，其效力要根据其合同约定的具体情况而定。
《民法典》第五百一十条规定，合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充；不能达成补充协议的，按照合同相关条款或者交易习惯确定。
二、合同的补充协议是什么意思
合同的“补充协议”或者称为“协议补充”，是指当事人对于合同中的内容没有约定或者约定不明确的，而达成的协议。“补充协议”是相对于已经存在的合同而言的，“协议补充”就是通过协议方式补充已经存在的合同中存在的漏洞。因此，已经存在的合同与“补充协议”之间是主从关系。已经存在的合同是主合同，“补充协议”是从合同。
三、补充协议书需要注意什么
补充协议书需要注意以下事项：
1.具体违约责任。应当规定产权证具体的获取日期以及约定具体的房屋质量标准。如果房地产开发商无法如合约所约定的履行，则可以约定相应的违约责任；
2.明确置业顾问承诺、广告描述和赠送的面积。置业顾问的承诺、广告描述及开发商所赠送的面积要写进补充协议。要将影响价格的广告描述和所看样板间中具体的品牌写进补充协议。还要把开发商赠送的面积包括具体位置、使用年限、装修标准在补充协议中详细阐述并注明使用权；
3.辨别文字游戏，以免开发商推脱责任；
4.警惕开发商利用补充协议转嫁风险；
5.注意优先效力，避免纠纷。仔细看补充协议的效力，防止开发商约定合同效力优先，那么有利于购房者的补充协议就形同虚设了。
《民法典》第五百四十三条当事人协商一致，可以变更合同。
第五百四十四条当事人对合同变更的内容约定不明确的，推定为未变更。