与silac、itraq/tmt等标记技术不同,label-free不需要对蛋白质样品进行任何标记处理,只要将蛋白质用trypsin酶解成肽段,进行lc-ms测试分析即可。label-free能保持样品的“真实性”;
原则上,label-free能分析无限多个样品,其通量要远高于silac、itraq/tmt等标记技术,是真正的高通量蛋白质分析技术。但是其也有本身的缺陷,即(1)对lc-ms的稳定性要求*;(2)每个样品至少要做3次技术重复或者生物学重复;(3)定量准确度与silac、itraq/tmt相比要差一些。
label-free技术可用于高通量的biomarker筛选、蛋白质相互作用、蛋白质翻译后修饰等方面的定量比较分析。
整体服务方案:
客户只需提供样本即可。我方负责完成后续所有实验,包括:
蛋白质提取与trypsin酶解。
每个样品进行3次lc-ms重复测试。
ms文件定性、定量分析,筛选差异蛋白。
差异表达蛋白常规生物信息学分析。
参考文献:
cell, 2015. 163(3): 712-23.
mol cell proteomics, 2015. 14(1): 120-35.
mol cell proteomics, 2013. 12(7): 2006-20.