普通玻璃和石英玻璃在成分上都含有二氧化硅，但是石英玻璃主要成分就是二氧化硅，而普通玻璃是二氧化硅、硅酸钠、硅酸钙的混合物，在硬度上石英玻璃也是要好于普通玻璃，石英玻璃可以达到摩式七级，普通玻璃是5.5-6级，再就是石英玻璃的耐高温，膨胀系数低、耐热震性、化学稳定性和电绝缘性良好。而普通玻璃则没有这些优点。
还有很重要的一点就是氢氟酸和热磷酸除外，石英玻璃对其它酸均表现为惰性，是的耐酸材料。在常温下碱和盐对石英玻璃的腐蚀程度也是极微的。 这是普通玻璃不具备的。
由此可以看出，石英玻璃在各个方便都要远远好于普通玻璃，所以在石英亚沸蒸馏水器上的应用更好，无论是使用还是产水的效果都要远远好于装配普通玻璃的蒸馏水器。