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28色方案,让树突状细胞分群更精细

2024/3/24 14:51:13发布17次查看
如何利用28色方案,让树突状细胞分群更精细
为什么要研究树突状细胞?
t和b淋巴细胞是适应性免疫系统的基本效应细胞,但apc(抗原递呈细胞)作为其上游,起着守门员的角色,几乎可以启动和塑造任何适应性免疫反应。树突状细胞(dc)就是apc中递呈抗原能力zui强的一种。
越来越多的证据表明,dc对于致耐受性或促炎性局部免疫环境是至关重要的,因此,在自身免疫性疾病以及癌症等疾病中,将dc的生物学机制研究清楚,就可能揭示治疗干预的新方法。
那么如何精细分出dc亚群呢?
在过去的十年中,小鼠和人类树突状细胞分类逐渐细化,这在很大程度上得益于流式细胞术和单细胞rna测序(sc-rnaseq)领域的技术发展。
在此,我们根据新的基于sc-rnaseq的分类,设计了28色方案来深入区分人dc亚群。大致思路如下:
采用cd45以在非淋巴组织样品中区分造血细胞与污染的基质细胞。
为区分dc亚群,用cd11c、hla-dr、cd141(也称为bdca-3,标记cdc1)、cd1c(bdca-1,标记cdc2)和cd123(pdc)。
增加15个表面分子,每个表面分子与炎症性疾病或抗肿瘤免疫的dc功能相关:共刺激分子cd40、cd80和cd86;低亲和力fc-受体cd16(fccriiia)和cd32(fccriia/b);趋化因子受体ccr7和cx3cr1;清道夫受体cd163;补体受体cd11b;cd85k(也称为ilt-3);btla(cd272,也称为b和t淋巴细胞衰减分子);cd26,cd38和cd172(也称为sirpa)。
为了更地圈门,加上了排除性的谱系标记物cd3(pan t细胞)、cd14(经典单核细胞)、cd19(b细胞)、cd56(nk细胞)以及cd4和cd8。
结合ccr7和cd45ra,该方案同时可评估t细胞亚群的分化状态。值得注意的是,ccr7也被证明是dc向引流淋巴结迁移所必需的。
❖详细
❖分析步骤详解
步,首先是常规的圈取液流稳定部分、选择单个核细胞区域、排除粘连体、圈选cd45+活细胞区域。
第二步,通过cd16/cd14,圈出cd14+单核细胞和cd14-细胞,接着将cd14-细胞显示在cd19/cd3图上,圈出cd3+t细胞、cd19+b细胞、cd3-cd19-细胞,在这里cd3+t可通过cd4/cd8分为cd4+t、cd8+t、dnt三个主要亚群;
对cd4+t和cd8+t两个亚群,可进一步通过ccr7和cd45ra圈出其中naive功能状态的亚群;而cd19+b细胞则可继续分析其cd80+的比例。
第三步,对第二步中圈出的cd14-cd3-cd19-部分细胞,进一步用cd56/cd123散点图分析,圈出cd56+nk、cd123高表达的pdc、cd56-cd123low的dc候选群体,接着可根据cd11c/hla-dr,圈出准确的双阳性dc群体,后根据cd141/cd1c分析dc(不包括pdc)中的三个亚群:cd141+dc、cd1c+dc、dn dc。
第四步,分析pdc、cd141+dc、cd1c+dc、dn dc四个亚群中cd26、btla、cd32、cd38、cx3cr1、cd85k、cd11b、sirpa、cd40、cd86、cd45ra的表达水平。
后一步,利用fmo作为设门对照,分析总dc中cx3cr1、cd85k、cd40、cd163、cd86的表达水平。
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