myisam是mysql的默认存储引擎，基于传统的isam类型，支持全文搜索，但不是事务安全的，而且不支持外键。每张myisam表存放在三个文件中：frm 文件存放表格定义；数据文件是myd (mydata)；索引文件是myi (myindex)。
innodb是事务型引擎，支持回滚、崩溃恢复能力、多版本并发控制、acid事务，支持行级锁定（innodb表的行锁不是绝对的，如果在执行一个sql语句时mysql不能确定要扫描的范围，innodb表同样会锁全表，如like操作时的sql语句），以及提供与oracle类型一致的不加锁读取方式。innodb存储它的表和索引在一个表空间中，表空间可以包含数个文件。
核心区别
myisam是非事务安全型的，而innodb是事务安全型的。
myisam锁的粒度是表级，而innodb支持行级锁定。
myisam支持全文类型索引，而innodb不支持全文索引。
myisam相对简单，所以在效率上要优于innodb，小型应用可以考虑使用myisam。
myisam表是保存成文件的形式，在跨平台的数据转移中使用myisam存储会省去不少的麻烦。
innodb表比myisam表更安全，可以在保证数据不会丢失的情况下，切换非事务表到事务表（alter table tablename type=innodb）。
应用场景
myisam管理非事务表。它提供高速存储和检索，以及全文搜索能力。如果应用中需要执行大量的select查询，那么myisam是更好的选择。
innodb用于事务处理应用程序，具有众多特性，包括acid事务支持。如果应用中需要执行大量的insert或update操作，则应该使用innodb，这样可以提高多用户并发操作的性能。
mysql的存储引擎和索引
数据库必须有索引，没有索引则检索过程变成了顺序查找，o(n)的时间复杂度几乎是不能忍受的。我们非常容易想象出一个只有单关键字组成的表如何使用b+树进行索引，只要将关键字存储到树的节点即可。当数据库一条记录里包含多个字段时，一棵b+树就只能存储主键，如果检索的是非主键字段，则主键索引失去作用，又变成顺序查找了。这时应该在第二个要检索的列上建立第二套索引。 这个索引由独立的b+树来组织。有两种常见的方法可以解决多个b+树访问同一套表数据的问题，一种叫做聚簇索引（clustered index ），一种叫做非聚簇索引（secondary index）。这两个名字虽然都叫做索引，但这并不是一种单独的索引类型，而是一种数据存储方式。对于聚簇索引存储来说，行数据和主键b+树存储在一起，辅助键b+树只存储辅助键和主键，主键和非主键b+树几乎是两种类型的树。对于非聚簇索引存储来说，主键b+树在叶子节点存储指向真正数据行的指针，而非主键。
innodb使用的是聚簇索引，将主键组织到一棵b+树中，而行数据就储存在叶子节点上，若使用where id = 14这样的条件查找主键，则按照b+树的检索算法即可查找到对应的叶节点，之后获得行数据。若对name列进行条件搜索，则需要两个步骤：第一步在辅助索引b+树中检索name，到达其叶子节点获取对应的主键。第二步使用主键在主索引b+树种再执行一次b+树检索操作，最终到达叶子节点即可获取整行数据。
myism使用的是非聚簇索引，非聚簇索引的两棵b+树看上去没什么不同，节点的结构完全一致只是存储的内容不同而已，主键索引b+树的节点存储了主键，辅助键索引b+树存储了辅助键。表数据存储在独立的地方，这两颗b+树的叶子节点都使用一个地址指向真正的表数据，对于表数据来说，这两个键没有任何差别。由于索引树是独立的，通过辅助键检索无需访问主键的索引树。
为了更形象说明这两种索引的区别，我们假想一个表如下图存储了4行数据。其中id作为主索引，name作为辅助索引。图示清晰的显示了聚簇索引和非聚簇索引的差异。
我们重点关注聚簇索引，看上去聚簇索引的效率明显要低于非聚簇索引，因为每次使用辅助索引检索都要经过两次b+树查找，这不是多此一举吗？聚簇索引的优势在哪？
1 由于行数据和叶子节点存储在一起，这样主键和行数据是一起被载入内存的，找到叶子节点就可以立刻将行数据返回了，如果按照主键id来组织数据，获得数据更快。
2 辅助索引使用主键作为指针 而不是使用地址值作为指针的好处是，减少了当出现行移动或者数据页分裂时辅助索引的维护工作，使用主键值当作指针会让辅助索引占用更多的空间，换来的好处是innodb在移动行时无须更新辅助索引中的这个指针。也就是说行的位置（实现中通过16k的page来定位，后面会涉及）会随着数据库里数据的修改而发生变化（前面的b+树节点分裂以及page的分裂），使用聚簇索引就可以保证不管这个主键b+树的节点如何变化，辅助索引树都不受影响。
所以在百万级数据及更大数据情况下，mysql innodb 的索引表现更加优秀！
以上就是mysql存储引擎：myisam和innodb的区别的详细内容。