有限公司股东出资不足的处理方式如下：
1.公司或者其他股东可以请求其向公司依法全面履行出资义务；
2.出资不足的股东在未出资本息范围内对公司债务不能清偿的部分承担补充赔偿责任；
3.还应当向已按期足额缴纳出资的股东承担违约责任。
根据《中华人民共和国公司法》第二十八条股东应当按期足额缴纳公司章程中规定的各自所认缴的出资额。股东以货币出资的，应当将货币出资足额存入有限责任公司在银行开设的账户；以非货币财产出资的，应当依法办理其财产权的转移手续。
股东不按照前款规定缴纳出资的，除应当向公司足额缴纳外，还应当向已按期足额缴纳出资的股东承担违约责任。
二、有限公司股东如何退股
有限责任公司的股东可以通过以下方式退股：
1.股权转让；
2.《中华人民共和国公司法》第七十四条特殊情形下的异议回购权；
3.减少注册资本；
4.公司解散。
《中华人民共和国公司法》第七十四条第一款规定，有下列情形之一的，对股东会该项决议投反对票的股东可以请求公司按照合理的价格收购其股权：
(一)公司连续五年不向股东分配利润，而公司该五年连续盈利，并且符合本法规定的分配利润条件的；
(二)公司合并、分立、转让主要财产的；
(三)公司章程规定的营业期限届满或者章程规定的其他解散事由出现，股东会会议通过决议修改章程使公司存续的
三、股东抽逃出资怎么办
股东抽逃出资，应补足出资，并会被处以所抽逃出资金额百分之五以上百分之十五以下的罚款。如果涉嫌构成抽逃出出资罪，罪名成立的需按照《刑法》第一百五十九条的规定承担刑事责任。
《公司法》第二百条规定，公司的发起人、股东在公司成立后，抽逃其出资的，由公司登记机关责令改正，处以所抽逃出资金额百分之五以上百分之十五以下的罚款。