公司扣除劳动者每月的绩效工资作为年终奖，是不合法的，公司不得克扣劳动者的工资。有下列情况之一的，才可以代扣劳动者的工资：用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；用人单位代扣代缴的个人所得税；其他。公司每个月扣绩效作为年终奖,合法吗的法律依据
法律依据：《工资支付暂行规定》第十五条用人单位不得克扣劳动者工资。有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：（一）用人单位代扣代缴的个人所得税；（二）用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；（三）法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；（四）法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。