债权债务清查的方法可以使用函证核对法。企业首先要检查本单位各项往来款项账簿记录是否正确和完整，在送对方单位核对。此项目的对帐单的内容可分为两部分，上半部分说明债务的原因、时间以及金额，并进行核对，下半部分是回单，对方单位要在核对的基础上说明是否有误及其有误的金额等。
二、债权债务追诉期多久
债权债务不适用追诉期，而是适用诉讼时效期限。向人民法院请求保护债权的诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
《民法典》第一百八十八条规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
三、债权债务关系的认定
1.能够证明债权债务关系存在的借据、收据、借贷合同等，或者与案件无利害关系的两个以上证人证明，或者其他证据线索。
2.担保书原件，或者负连带责任人的基本情况，以及他们现实经济状况和偿还能力的证据。
3.抵押物的名称、数量、规格、质量及价款数额等到情况的证明。
《中华人民共和国民法典》 第三百零七条 因共有的不动产或者动产产生的债权债务，在对外关系上，共有人享有连带债权、承担连带债务，但是法律另有规定或者第三人知道共有人不具有连带债权债务关系的除外;在共有人内部关系上，除共有人另有约定外，按份共有人按照份额享有债权、承担债务，共同共有人共同享有债权、承担债务。偿还债务超过自己应当承担份额的按份共有人，有权向其他共有人追偿。