便携式叶绿素测定仪有两种操作方法，第一种是单手操作与快速田间测量。单手操作意味着研究人员只需要使用一只手就可以通过仪器完成叶绿素的测量实验。使用叶夹进行在荧光测量前的暗适应过程，在叶绿素测量时，只需要将测量探头放置于叶夹上，打开开叶夹遮光片。将暗适应后的叶片暴露在由660nm固态光源提供的激发光下，测量光波，然后进行叶绿素计算。
叶绿素快速田间测量是指快速测量经过暗适应的叶片叶绿素值，是科研究人员进行植物胁迫实验的理想仪器。叶绿素值可以通过仪器的液晶显示屏进行显示。叶绿素测定仪可以存储最多20000条实验数据以及32条实验迹线，自动存储实验时间。叶绿素测量数据可通过usb传输到电脑上进行总结和分析。
便携式叶绿素测定仪使用注意事项：
1. 一般来说我们常常利用叶绿素测定仪来测定植物的叶绿素含量，并以此判断植物的氮元素含量，但是在测算的过程中，确定spad临界值是十分关键的，而由于同一生长条件下不同品种间spad值存在较大差异，因此针对于不同的品种，要建立不同的spad临界值，这样以来利用叶绿素测定仪测算的氮元素含量才有可能是准确的。
2. 在使用叶绿素测定仪测定的过程中，如果选用的叶位不同，那么可能得到的测定结果也不同，因此为了得到具有代表性的测定结果，首先应该要同意所选的叶位，一般来说，植株的顶部的几片叶片受土壤中的氮元素含量的影响比较的小，所以在使用进行叶绿素测定仪测量的过程中可以选用顶部的那几片叶子。
3. 就同一片叶片而言，其不同的位置测得的spad值也是不同的，比如说玉米在叶片中部距基部55%的位置测定结果偏差小，而在40%～60%区域内测定值变异系数比较低。因此在使用叶绿素测定仪测定的过程中，还需要注意测量方位的选择，以避免测定误差。