根据氨基酸组成分析可以对蛋白质及肽进行鉴别，氨基酸分析法可用于确定蛋白质、肽及氨基酸的含量，及测定可能存在于蛋白质及肽中的非典型氨基酸。进行氨基酸分析前，必须将蛋白质及肽水解成单个氨基酸，具体水解方法由各品种项下规定。蛋白质及肽水解后，其氨基酸分析过程与用于其他药物制剂中游离氨基酸的分析过程相同。
本法包括四种柱前衍生法，分别为异硫氰酸本酯（pitc）法、6-氨基喹啉－n－羟基琥珀酰亚氨基氨基jia酸酯（aqc）法、邻本二醛（opa）和9-芴jia基氯jia酸jia酯（fmoc）法、2，4-二硝基氟本（dnfb）法，以及一种茚三酮柱后衍生法。不同的品种应针对自身所含的氨基酸种类及各氨基酸的含量选择适宜的氨基酸分析方法并做相应的方法学验证。
由于本法衍生过程中衍生溶液量较少，且容易挥发，外标法极易出现较大的误差，建议采用内标法进行测定，内标的确定由各品种项下规定。在本法中，由于半*或*的衍生产物不稳定，因此对于含半*或*的样品衍生后应尽快测定，或者在衍生前对半*或*进行适当的处理，使其转化为稳定地产物（如磺基*或半*-硫代丙酸）后再衍生测定，具体方法由各品种项下规定。在测定过程中，可根据所用的仪器、色谱柱品牌、色谱柱的长度及要分离的氨基酸种类，对流动相的有机溶剂和洗脱梯度作适当调整以获得较好的分离度。
*法 pitc柱前衍生氨基酸分析法
本法系根据氨基酸与异硫氰酸本酯（pitc）反应，生成有紫外响应的氨基酸衍生物本氨基硫jia酰氨基酸（ptc-氨基酸），ptc-氨基酸经反相液相色谱分离后用紫外检测，在一定的范围内其吸光值与氨基酸浓度成正比。本方法的线性浓度范围为0.025～1.25µmol/ml。
试剂 （1）流动相a 0.1mol/l醋酸钠溶液（取无水醋酸钠8.2g，加水900ml溶解，用冰醋酸调ph至6.5，然后加水至1000 ml）-乙腈（93:7）。
（2）流动相b 乙腈－水（8：2）。
对照品溶液 按各品种项下规定的方法制备。
供试品溶液 按各品种项下规定的方法制备。
色谱条件与系统适用性试验 用十八烷基硅烷键合硅胶为填充剂（sma氨基酸分析色谱柱）；流速为每分钟1.0ml；柱温为40℃；检测波长为254nm。各氨基酸峰间的分离度均应大于1.0。洗脱梯度如下：
时间（min）流动相a（%）流动相b（%）
01000
148515
296634
300100
370100
37.11000
451000
测定法 精密量取氨基酸对照品溶液200μl，置一2ml塑料离心管中，精密加入1mol/l三乙胺乙腈溶液100μl，混匀，精密加入0.1mol/l异硫氰酸本酯乙腈溶液100μl，混匀，室温放置1小时，加0.8ml正己烷，剧烈振摇，放置10min，精密取下层溶液2μl，注入液相色谱仪，记录色谱图；另精密量取供试品溶液200μl，自“置一2ml塑料离心管中”起同法测定。