处罚非法转让农村土地使用权如下：由县级以上人民政府自然资源主管部门责令限期改正，没收违法所得并处罚款。转让土地使用权的转让人必须是依法取得国有土地使用权的受让人，同时必须按照转让合同的约定支付转让金，土地使用权的转让不得违反合同的规定。农村非法转让土地使用权会怎么处罚呢的法律依据
《土地管理法》第八十二条擅自将农民集体所有的土地通过出让、转让使用权或者出租等方式用于非农业建设，或者违反本法规定，将集体经营性建设用地通过出让、出租等方式交由单位或者个人使用的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令限期改正，没收违法所得，并处罚款。