氨氮在线分析仪通过嵌入式工业计算机系统的控制，自动完成水样采集。水样进入反应室，经掩蔽剂消除干扰后水样中以游离态的氨或铵离子（nh4+）等形式存在的氨氮与反应液充分反应生成黄棕色络合物，该络合物的色度与氨氮的含量成正比。反应后的混合液进入比色室，运用光电比色法检测到与色度相关的电压，通过信号放大器放大后，传输给嵌入式工业计算机。嵌入式工业计算机经过数据处理后，显示氨氮浓度值并进行数据存储、处理与传输。氨氮在线分析仪适用于生活污水、工业污染源、地表水中氨氮含量的测量。
氨氮是指水中以游离氨(nh3)和铵离子(nh4)形式存在的氮。动物性有机物的含氮量一般较植物性有机物为高。同时，人畜粪便中含氮有机物很不稳定，容易分解成氨。因此，水中氨氮含量增高时指以氨或铵离子形式存在的化合氨。氨氮在线分析仪就是安装于特定位置的污染源，24小时连续不间断地对污染源进行氨氮分析的仪器。
氨氮在线分析仪在ph值大于11的环境下，铵根离子向氨转变，氨通过氨敏电极的疏水膜转移，造成氨敏电极的电动势的变化，仪器根据电动势的变化测量出氨氮的浓度。
氨氮在线分析仪的操作步骤：
1、用新的水样冲洗测量水样、试剂体积的容器和电极安装管。
2、使用蠕动泵进样。水样并不直接与蠕动泵管接触--有一个空气缓冲区。进样的体积由一可视测量系统控制。
3、与进样相同，辅助试剂也通过蠕动泵投加，并由可视测量系统控制加药体积。
4、通过鼓泡混合水样和试剂。
5、由测量系统自动控制反映时间。
6、残液由蠕动泵排出。
7、在用户自定义的测量周期中，分析仪会利用内置的校准标液和清洗溶液自动进行校准和清洗。