（1）次氯酸钠发。次氯酸钠是普通的化学试剂，起运输，储存和购买都比较方便。次氯酸钠溶于水生产次氯酸根离子，可用于消毒杀菌，但它不稳定，光照，受潮易于分解，消毒能力很弱。
（2）次氯发。氯在水中能迅速产生次氯酸根离子。该方法目前已广泛应用于医院的废水消毒。氯中有效氯含量比次氯酸钠溶液高5-10倍，消毒能力强且价格便宜。由于它一种强刺激性有毒的气体，因此要用的存储设备进行存储。
（3）二氧化氯发。二氧化氯是一种强氧化剂，它可以杀灭细菌，繁殖体，真菌和病毒等。有关研究表明，二氧化氯溶于水后，有50%-7o%转变为次氯酸根离子和亚氯酸根离子，对红细胞有损害，会使血液*升高。因此，目前一般用前两种方法处理医院废水。臭氧也可用于医院废水消毒，但它必须现场制备