婚姻协议中经济补偿条款一般是有效的。但还需满足如下条件：1、双方婚姻关系合法有效；2、夫妻一方因抚育子女、照料老年人、协助另一方工作等负担较多义务的；3、意思表示真实；4、不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。婚姻协议中经济补偿条款是否有效的法律依据
《中华人民共和国民法典》第一百四十三条
具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。
第一千零八十八条
夫妻一方因抚育子女、照料老年人、协助另一方工作等负担较多义务的，离婚时有权向另一方请求补偿，另一方应当给予补偿。具体办法由双方协议；协议不成的，由人民法院判决。
第一千零九十条
离婚时，如果一方生活困难，有负担能力的另一方应当给予适当帮助。具体办法由双方协议；协议不成的，由人民法院判决。