办理保障性住房房产证的流程是：规划设计院进行房产地形测绘，换取入库通知书，规划局验收后规划许可证副本换为正本；资料报送城建档案馆换取回执，凭回执、竣工资料送质监站申请验收，领取单位工程竣工证明书；到建设局窗口备案，给予回执单；缴纳税金开具完税证明，领取房产证。保障性住房房产证怎么办理的法律依据
《城市房地产管理法》第六十条国家实行土地使用权和房屋所有权登记发证制度。《民法典》第二百零九条不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。