液相色谱分析的流程：
由泵将储液瓶中的溶剂吸入色谱系统，然后输出，经流量与压力测量之后，导入进样器。被测物由进样器注入，并随流动相通过色谱柱，在柱上进行分离后进入检测器，检测信号由数据处理设备采集与处理，并记录色谱图。废液流入废液瓶。
遇到复杂的混合物分离（性范围比较宽）还可用梯度控制器作梯度洗脱。这和气相色谱的程序升温类似，不同的是气相色谱改变温度，而hplc改变的是流动相性，使样品各组分在佳条件下得以分离。
液相色谱分析应用领域：
环境：常见无机阴阳离子、多环芳烃、多氯联苯、硝基化合物、有害重金属及其形态、除草剂、 农药、酸沉降成分。
农业：土壤矿物成分、肥料、饲料添加剂、茶叶等农产品中无机和有机成分。
石油：烃类族组成、石油中微量成分。
化工：无机化工产品、合成分子化合物、表面活性剂、洗涤剂成分、化妆品、染料。
材料：液晶材料、合成分子材料。
食品：无机阴阳离子、有机酸、氨基酸、糖、维生素、脂肪酸、香料、甜味剂、防腐剂、人工色素、病原微生物、霉菌毒素、多核芳烃。
生物：氨基酸、多肽、蛋白质、核糖核酸、生物胺、多糖、酶、天然分子化合物。
医药：人体化学成分、各类合成药物成分、各种天然植物和动物药物化学成分。