1、堆藏：刚南瓜买回来后可以直接堆放在室内存放，堆放钱在地面上先铺上一层细沙、麦秸或者是稻草，再在上面堆放南瓜，但是堆放的时候需要注意流出通道，以便后期检查。南瓜摆放的方向是需要生长时的状态相同，可以将瓜蒂朝里，瓜顶向外逐个依次堆放成圆锥，每堆15-25个，高度5-6个瓜高为好，也可以装筐堆藏，装筐则不宜太满，离筐口有1个瓜的距离即可。同时要注意前期储藏外界温度会比较高，需要注意通风换气，保持室内的新鲜干燥，并且保持清凉，储藏后期外界的温度比较低时，就需要开始防寒，温度最好是保存在0摄氏度以上。
2、架藏：架藏的仓位选择、质量的挑选、降温、防寒防冻和通风等要求与堆藏的是一样的，有不一样的地方就是在仓库内用木、竹或者铁塔成分层储藏架，铺上草包，将南瓜堆在架子上，或者是用板条箱衬垫一层麦秸后，将南瓜叠放成一定形式进行储藏。这种方式比较容易通风散热，而且便于观察检查。
3、窖藏：窖藏的南瓜应该是选用主蔓上的第二个瓜最好，根瓜是不宜储藏的。南瓜被采收后先将其放在24-27摄氏度下放置2周，使南瓜皮硬化，这样有利于储藏，而且在窖藏南瓜的时候要防止太阳暴晒，禁止滚动、抛掷，否则瓜瓤震动受伤易导致腐烂。
4、切开的南瓜保存：若是南瓜已经被切开了，则先需要将南瓜中的瓤挖出来，放入水中，不可水洗。然后用小勺子将盐均匀的抹在了南瓜的切口上，或者是用纸巾将其包住南瓜切口处也可以，然后用保存保鲜膜将南瓜给包好，特别是切口处要包裹严实，不能漏气，然后将南瓜放入冰箱冷藏室内就可以了，一般可以保存一个月左右。