企业所得税一般按照按月（季）预缴年终汇算清缴。企业所得税适用税率25%，符合条件的小型微利企业可减按20%税率计算缴纳。
企业所得税的征收方式有2种，一种是查账征收、另一种是核定征收
1、查账征收：是按照实际利润额依照适用税率计算缴纳，而实际利润额=利润总额-以前年度待弥补的亏损额-不征税收入-免税收入。其中：利润总额=营业收入-营业成本-营业税金及附加-管理费用-销售费用-财务费用+其他业务利润+营业外收支+投资收益。
因此实际利润额不是您所讲的（1000-100）的概念，100元不代表贵公司的实际营业成本、费用和税金（不含增值税、企业所得税）。
2、核定征收：是按照销售（营业）收入*核定所得率*适用税率计算缴纳。其中：销售（营业）收入包括：应税销售额、其他业务收入和视同销售额，核定所得率是主管税务机关根据行业不同事前设置的（一般幅度处5%-30%之间，不过具体到贵公司应当根据主管税务机关确定的所得率计算，适用税率25%的核定征收不适用20%的税率。）