根据《国家税务总局关于调整个人取得全年一次性奖金等计算征收个人所得税方法问题的通知》(国税发[2005]9号)中的规定计算，纳税人取得全年一次性奖金，单独作为一个月工资、薪金所得计算纳税，由扣缴义务人发放时代扣代缴。
年终奖所得，将年终奖金额除以12个月，以每月平均收入金额来确定税率和速度扣除数，年终奖所得税率表与工资、薪金所得的税率表相同，但计算方式不同。
年终奖计算办法：
1：月工资所得高于(或等于)税法规定的费用扣除额。
先将雇员当月内取得的全年一次性奖金，除以12个月，按其商数确定适用税率和速算扣除数。
应纳税额 = 雇员当月取得全年一次性奖金×适用税率 - 速算扣除数
2：月工资所得低于税法规定的费用扣除额。
将全年一次性奖金减除雇员当月工资薪金所得与费用扣除额的差额后的余额，按上述办法确定全年一次性奖金的适用税率和速算扣除数。
应纳税额=(雇员当月取得全年一次性奖金 - 雇员当月工资薪金所得与费用扣除额的差额)×适用税率-速算扣除数
举例来说
2018年1月份工资5000元，2017年度的年终奖金12000元，当月需缴纳的各项社会保险费1000元，那么1月应缴纳多少个人所得税？
工资应纳税所得额 = 5000 － 1000 － 3500 = 500元。
工资应纳个税 = 500 × 3% － 0 = 15元。
年终奖金12000元，除以12后，每月平均1200元，对照上述年终奖税率表得到，税率3%，速算扣除数为0，则应纳个税为：
年终奖金应纳税额 = 12000 × 3% － 0= 360元。