医疗保险反欺诈信息系统又称医保智能审核系统，能完成医保单据的全面快速审核，准确地发现违规行为、扣除违规款项并及时反馈各医疗机构审核结果。
2016年，通过系统的决策分析功能，发现多家医院存在非医保项目匹配成医保项目的违规情况，社保经办机构及时派人进行处理，避免医保基金的大量违规使用。截至去年12月，医疗保险反欺诈信息系统共审核单据量为2544.67万张，审核总金额76.77亿元，医保内金额50.10亿元，其中，发现问题单据数量为108.33万张。
医保反欺诈信息系统自2011年推广以来，目前已覆盖了广西10个地区市本级和县份的1488家定点医疗机构和2463家定点药店。其中，柳州市率先实现市本级二级及以上定点医疗机构的医保基金支付结算实时审核。
一段时间以来，乱刷医保卡、骗取套取医保基金、违规加价收费等行为已涉及参保人员、定点零售药店和定点医疗机构各方主体，审计部门在每一环节都发现了不少问题。这与医保管理部门队伍不足有关，医疗保险具有复杂性，而医保机构人手不够，防不胜防；同时制度本身也存在问题，医疗机构和患者利益比较一致，比较容易结成同盟，出现问题。
原因错综复杂、涉及利益主体多元化，凸显了完善医保制度建设、加强医保基金综合监管的必要性和紧迫性。专家直言，要鼓励和支持商业健康保险机构参与医保经办服务，完善医疗保险对医疗服务的监控机制，全面推广医保智能监控，逐步实现对定点机构的事前、事中和事后的全程监管，提升医保管理服务水平等。
医疗服务本身“不管起来”，医保等问题“很难管”，主要问题还是在医疗机构，医保管理部门“权力太小”，受制于医疗机构的潜在权力。