2、疏水键。疏水键是多肽链上的某些氨基酸的疏水基团或疏水侧链（非极性侧链），由于避开水而造成相互接近、粘附聚集在一起。它在维持蛋白质三级结构方面占有突出地位。
3、离子键。指阴离子，阳离子间通过静电作用形成的化学键。离子键属于化学键，大多数的盐，由碱金属或碱土金属形成的键，活泼金属氧化物都有离子键。含有离子键的化合物称为离子化合物。离子键与物体的熔沸点和硬度有关。
4、氢键 。氢原子与电负性大的原子x以共价键结合，若与电负性大、半径小的原子y接近，在x与y之间以氢为媒介，生成x-h…y形式的一种特殊的分子间或分子内相互作用，称为氢键。