2、第二期学费：到了2016年，学制和学费变成了3年36万（不包括交通、住宿以及游学费用），其中前两年每两个月集中学习三至四天，后一年为跟踪期。并且，毕业后没有任何学历学位。
3、第三学期：马云说，湖畔的精髓就是失败教育，因为创业就像打仗，能活下来才算是真实有意义的事情。湖畔一期的周航也谈到了湖畔的失败教育，失败是为了让我们接受并认可失败，因为对于创业者来说，失败太正常了，成功才不正常。
4、湖畔大学的学制为3年（前2年集中学习，每2个月一次，每次3~4天，后一年为跟踪期）学费总共36万。三年中除了每两个月4天的集中学习模块，还有每两个月一家企业的小组案例研究，以及贯穿全年的湖畔大学app在线学习。