合理施用石灰是中和土壤酸性，特别是表土层的酸度；补充土壤钙含量，减少土壤对磷和钼的固定，促进有机氮、磷化合物的分解释放，消除过量铝、铁、锰等的毒害；增强土壤有益微生物活动，改善土壤物理性状，抑制与杀灭土传病发生与蔓延，提高土壤ph值的重要措施。
1、施用量确定 主要依据不同质地耕地土壤反应(ph值高低)确定石灰的施用量。石灰施用采用5年1个轮回的方法进行，即第2年、第3年施用量分别减至第1年的75%、50%，第4年、第5年停止施用。
2、施用时期确定 为错开农忙和高温季节施用石灰，每年一次的石灰施用时期应根据不同种植制度灵活确定，以方便农民使用。
⑴早稻-晚稻-冬闲耕作制度区。选择在冬季或早稻移栽前1个月左右将石灰均匀撒施水田内，随即翻耕或在早稻移栽前翻耕。
⑵早稻-晚稻-油菜/绿肥耕作制度区。选择在油菜秆或绿肥翻耕前二三天将石灰均匀撒施水田内，随即翻耕移栽早稻。
⑶油菜-中稻耕作制度区。选择在油菜收获后中稻移栽前15天左右将石灰均匀撒施在水田内，随即翻耕或在中稻移栽前翻耕。
⑷烤烟-晚稻耕作制度区。选择在冬季或在烤烟移栽前1个月左右将石灰均匀撒施水田内，随即翻耕。施用石灰时必需配合施用有机肥料和氮、磷、钾及微量元素，但不宜与腐熟人畜粪尿、铵态氮肥混存或混用，以免造成氮素损失。也不应与磷肥、硼肥等混用，以防有效性降低。