（1）个体工商户一般是税务机关根据其所在的位置、规模、员工人数以及销售商品等等来估算你的销售额之后再给定税，无论当月的收入是多少，有无收入都需要要按定税金额来交税；而有限责任公司则是一般要求企业必须核算健全、要有帐目，因为企业交税是根据企业申报的收入来交税，有收入就交、没有则不交。
（2）个体工商户或者个人独资企业的经营所得只需缴个人所得税；有限责任公司的经营所得要缴纳企业所得税、缴纳个人所得税。
（3）个体工商户或个人独资企业的征税一般采取定额定率征收方式；有限责任公司的征税：营业交易的环节按照发票征税，经营所得环节一般采取核定征收或查帐征收2种方式。
另外个体工商户注册登记时无需公司章程，而有限责任公司注册时则需公司章程。