微商城是通过第三方开发商来完成的，通过搭建微商城，商家可以在线上销售的同时，同时还可以实现各种打折促销活动。但微商城没有独立的二维码，搭建在微信服务号基础之上，用户触达产品的层次比较深，只有铁粉才容易转化成交易用户。更何况在这之前必须有较好 的公众号运营才能吸收到粉丝，或者是投钱进行地推活动吸纳线下粉丝到线上。
但是微信小程序诞生以后，情况就发生了很大变化！微信小程序不需要关注，即用即走，可以依赖公众号，也可以独立推广。附近的小程序直接展示引流，二维码扫描直接触达，搜一搜直接发现小程序商城系统商品和服务、好友聊天相互分享等等。而且还可以通过在线点单，到店消费；提前预定，货到付款等形式。把线上的用户，引导店里进行消费。
这么一对比就非常明朗了，微商城和小程序商城系统的基本不同就在于：
推广的形式不同，微商城依赖于公众号，小程序商城系统可以独立推广。
用户流量的导向不同，微商城统一导向线上，小程序商城系统链接线上线下
接口的种类不同，微商城仅有公众号菜单栏一个入口，源程序接口种类现今已有32个
流量的转变效率不同，微商城仅从粉丝上进行转变，小程序商城系统可以覆盖所有微信用户 ，用线下定位范围用户。
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