长期施用化学肥料，导致土壤板结、盐渍化，引起根系早衰，无法正常吸收运转水分、养分，光合速率下降，在果实成熟期，会出现茄红素形成不良，导致果实出现着色不均问题。
2、温度不适。
西红柿在果实着色期，温度高于32℃和低于8℃不利于茄红素的形成，这两种温度下果实表面形成的黄绿斑点即便西红柿适应了此种温度，西红柿果面的黄绿斑点也无法消失。
3、肥水管理不当。
在番茄果实第二穗膨果时，若不及时追肥，极易造成番茄营养不足，使茄红素形成不良，出现番茄着色不均问题。
4、营养不均衡。
番茄果实生长期间对养分的需求量较大，一旦某一养分缺乏或过量，都会引起着色不均。如结果时期氮肥供应过多，会造成钾、钙、硼养分之间的拮抗，引起花青素形成不均匀。
5、番茄栽种过密，棚膜脏未擦，老叶病叶较多。
番茄栽种过密、棚膜脏未擦、老叶病叶较多都会导致番茄果实的透风透光性过差，影响果实茄红素的形成。
番茄着色不均预防要点：
1、移栽前改土，少施化肥，多施有机肥、生物菌肥。用奥农乐配合有机肥改良土壤，调节土壤ph，改善土壤团粒结构，改善土壤微环境。有机肥、生物菌肥可以用奥土沃，用粮食级原料充分腐熟，真正的功能菌。
2、提高水肥管理。果实生长期间对养分需求量较高，在第1穗果时可以不用追肥，但第二穗果之后一定要追肥，可以用高氮高钾型水溶肥料，为作物补充养分，促进果实膨果。
3、营养不均衡可以用沃丰素+芸苔素缓解，沃丰素所含养分较全面，多糖、中微量元素都包含，芸苔素可以调节作物生长。另外注意通风，防止出现温度过高的情况。
4、转色期喷雾磷酸二氢钾+芸苔素，有助于促进果实转色，提高果实口感。
5、注意棚膜擦拭，控制栽种密度。温室种植番茄早熟品种栽植密度大约350株/亩，晚熟品种控制在2000—2500株/亩。普通露地栽培2500-3000株/亩。
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形态特征
番茄是一年生草本植物，株高0.6-2米，全体生粘质腺毛，有强烈气味。茎易倒伏。叶羽状复叶或羽状深裂，长10-40厘米，小叶极不规则，大小不等，常5-9枚，卵形或矩圆形，长5-7厘米，边缘有不规则锯齿或裂片。花序总梗长2-5厘米，常3-7朵花；花梗长1-1.5厘米；花萼辐状，裂片披针形，果时宿存；花冠辐状，直径约2厘米，黄色。浆果扁球状或近球状，肉质而多汁液，桔黄色或鲜红色，光滑；种子黄色。花果期夏秋季。
生育周期
番茄发芽期：从播种到第1片真叶出现（破心）。在正常温度条件下这一时期为7～10天；
幼苗期：是指从第1片真叶出现至第1花序现蕾。此期适宜昼温为25～28℃，夜温为13～17℃。此期地温对幼苗生育有较大的影响，适宜的地温应保持在22～23℃；始花座果期是指从第1花序现蕾至座果。这个阶段是番茄从以营养生长为主过渡到生殖生长与营养生长同等发展的转折时期，直接关系到产品器官的形成及产量；
结果期：从第1花序着果到采收结束（拉秧）。这一时期果、秧同时生长，解决好营养生长与生殖生长的矛盾，是这一时期的关键要务。