1、银花河，是丹江上游最大的一条支流，源地有二；南源是东西沟，发源于鹘岭余脉—海拔1468.4米的板板山东侧；北源是北河，发源于流岭南麓坡脚，两源于高坝相汇合，流向为东—西向，先后接纳南家垤河、大庙沟、洛峪河、商路河、古路河和石槽沟等主要支流，于竹林关注入丹江。
2、武关河，是丹江上游较大的一条支流，发源于海拔1744米的蟒岭主脊南侧，向东南流到庚家河，到石门后始称武关河，到峦庄转折为南—北流向，经武关、毛坪、于毕家湾注入丹江。武关河支流众多，较大的有峡河、桃坪河、赵川河和白阳关河等，两侧大小支流作对称状分布，流域平均宽度为7.7公里，是一条比较明显的树枝状水系。
3、南秦河，又名乳水、楚水，是丹江一级支流，发源于商州市西部东岳庙乡鸡冠岭，流向由西向东，流程48公里，至刘湾乡汇入丹江。流域面积575.9平方公里，海拔702～1577.6米，总落差875.6米，平均比降0.83%。主要支流有林岔河、石道峪、赤水峪、石龙湾河、金陵寺河、刘峪河。南秦河多年平均径流量1.6亿立方米，径流模数为7.93立方米/秒平方公里，平均流量3.53立方米/秒，实测最大流量441立方米/秒。