不同点:
F.A.是属普惠制原产地证。
C.O.是属一般原产地证。
F.A.普惠制原产地证。是互惠的，是主动的。
C.O.一般原产地证，仅证明产地，是被动的。
在进口清关时，出示F.A.普惠制原产地证，货物可享受最惠国税率征税。（在普惠制协约国内）。是无条件地享受的，所以是主动的。
在进口清关时，出示C.O.一般原产地证，货物仅享受普通税率征税。只有双方国家签有享受最惠国待遇的前提下，出示C.O.一般原产地证，货物才可享受按最惠国税率征税。以美国为首的一些国家歧视中国，所以多以这种做法。这就是被动的原因。
（1）一般原产地证CO和普惠制FA的主要区别在于：是否可以享受特定的关税减免优惠——一般原产地证CO不能享受关税减免优惠，普惠制FA可以享受关税减免优惠。其他区别还有适用的国家不同（一般原产地证CO任何国家都可以，普惠制FA只适用于英国、法国、德国、意大利、荷兰、卢森堡等39个国家），签发机构也不同（一般原产地证CO由贸促会签发，普惠制FA由出入境检验检疫局签发。）
（2）原产地证是证明一批货物的原产国或地区的一种证书。其主要作用是申请进口国关税减免（优惠原产地证的主要用途）和便于进口国进行特定贸易管制（非优惠原产地证的主要用途）。其中，一般原产地证CO就是非优惠原产地证的一种，普惠制FA就是优惠原产地证的一种。因此，这两者的主要区别在于：是否享受优惠。
