债权和债务进行清理和核算，为财务管理体制和行政隶属关系的变化奠定财务基础。
步骤
事业单位进行财务清算时，应当在主管部门和财政部门、国有资产管理部门的监督指导下，成立清算组。
清算组一般由划转撤并的事业单位负责人和财务、审计、监察、物资、后勤、人事、工会等
部门的人员组成，并需报经有关部门批准，
在主管部门、财政部门和资产管理部门的监督指导下开展工作。
清算组对清算期间的事业单位财务运行状况负责。
清算组应首先制定清算方案；
然后对单位的财产、债权、债务等进行全面清理，编制财产目录和债权、债务清单；
提出财产作价依据和债权、债务处理办法，作好国有资产的移交、接受、划转和管理工作，并妥善处理各项遗留问题。
科学事业单位财务清算规定
《科学事业单位财务制度》第九章
第四十条 科学事业单位按照规定划转撤并时，应当对单位的财产、债权和债务进行清算。
第四十一条 科学事业单位财务清算期间，应当在财务主管部门和财政部门、
国有资产管理部门的监督指导下成立财务清算机构。
财务清算机构应当制定清算方案，对单位的财产、债权、债务等进行全面清理，
编制财产目录和债权债务清单，提出财产作价依据和债权债务处理意见，
做好国有资产的移交、接收和划转的准备工作。
第四十二条 财务清算意见报经财务主管部门审核并报国有资产管理部门和财政部门批准后，
由财务清算机构妥善处理单位各项遗留问题。
第四十三条 科学事业单位财务清算结束后，
经财务主管部门审核并报国有资产管理部门和财政部门批准，其资产分别按照下列办法进行处理：
（一）因隶属关系改变，成建制划转的单位，全部资产无偿移交，并相应划转事业经费指标。
（二）转为企业管理的单位，其全部资产扣除负债后，转作资本金。
（三）撤销的单位，全部资产由财务主管部门和财政部门核准处理。
（四）合并的单位，全部资产移交接收单位或者新组建单位，
合并后多余的国有资产由财务主管部门和财政部门核准处理。