菌株性能：枯草芽孢杆菌的种类有上百种，并不是每一种都有较强的水质改良性能，他需要大量的实验验证和筛选，而很多厂家则直接批量购买芽孢杆菌原粉然后发酵扩增，缺乏定向的原发性筛选，当然对该菌株的理化特性也没有充分了解和研究，用到池塘中效果如何只能看运气了。菌株复配，目前新研究发现，多种功能协同的枯草芽孢杆菌复配，能大大提高产品性能。而限于研发及资源整合能力，市场上复配产品基本上是盲目混合而成，缺乏对菌株间协同拮抗性能和菌株特性的研究，导致功能稳定性差、无法协同增效。而国外应用的芽孢产品研究较为充分。
养殖池塘中耗氧因子根据养殖特点分为养殖动物呼吸、水呼吸和泥呼吸。“水”呼吸是指水中的浮游生物、浮游细菌、水中溶解态和颗粒态有机物的呼吸耗氧。“泥”呼吸包括养殖水体底泥中含有的各种有机质及底栖生物类群代谢耗氧。下表中将不同养殖池塘各种呼吸所占比例明确标注出来。养殖池塘中耗氧最多的是“水”呼吸，影响“水”呼吸大的因素是浮游生物、浮游细菌数量和有机物浓度。浮游生物和浮游细菌浓度也取决于水体有机物含量，有机物丰富促进浮游生物和细菌繁殖。也就是说，养殖池塘水体耗氧量最终取决于水体中有机物含量。 需要关注的另一个耗氧因子是“泥”呼吸，尤其是对虾养殖中后期池塘。池底残饵粪便大量积累，池底有机物分解需要消耗大量氧气。养殖池塘减少耗氧关键是提高饲料利用率，减少残饵。 大量文献研究表明使用芽孢杆菌后会大大降低养殖池塘cod，那cod与养殖池塘的溶解氧有什么关系呢？我们首先科普一下所谓的cod，cod是指水体中能被氧化的物质进行化学氧化时消耗氧的量，一般以每升水消耗氧的毫克数来表示。也就是说使用芽孢杆菌可以降低池塘的耗氧水平，起到减少氧气消耗的作用。说到底，引起养殖池塘大量缺氧的主要原因是水呼吸和泥呼吸，而水呼吸和泥呼吸的大小主要取决于养殖池塘有机物的含量。使用芽孢杆菌可以分解水体有机物，减少有害菌厌氧发酵，进而起到降低池塘cod作用，只是这个过程相对较长。也许会有人说，很多案例表明使用芽孢杆菌后没有起到文中提到的降低cod的效果，反而会造成缺氧泛塘的现象。使用芽孢杆菌造成池塘缺氧主要包括以下三种情况：①连续阴雨天气，养殖池塘有机负荷较高，而且养殖池塘已处于缺氧状态，芽孢杆菌使用，短期内会消耗掉部分氧气，成为压倒骆驼的最后一根稻草；②部分养殖池塘，藻类严重老化，使用芽孢后营养竞争造成“倒藻”，死亡藻类消耗掉大量氧气造成池塘缺氧；③最常见的是养殖池塘有机物含量过多，健康藻类含量低，不管此时是否使用芽孢杆菌，都容易发生缺氧，此时应该开启增氧机，使用化学增氧类底质改良剂，提高养殖池塘溶氧量，降低缺氧风险。
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