冷饮微生物超标现象严重，冰淇淋是冷饮的一个主要品种，由于它具有工艺新颖、配方独特、风味甜美、组织细腻、质地润滑、柔润可口等特点。冰淇淋的主要指标有理化、感官与微生物 3项，厂家自抽样品或质检部门的抽样结果表明，理化与感官质量指标不合格比例低于微生物的不合格比例。微生物指标有细菌总数、大肠菌群与致病菌 3种。
据经验了解，避免冰淇淋微生物指标不合格，应先从原因、机理、制度等几个方面着手。
据分析，冰淇淋微生物指标不合格，最常见的就是菌落总数超标及大肠杆菌杆菌超标。为了避免或防止冰淇淋的二次污染，在严格控制加工工艺操作的同时，应注意以下几点：
1、原辅材料的污染 在加工冰淇淋时，奶制品、蛋制品、甜味剂、稳定剂及香精等在贮存过程中会污染上一定的细菌，甚至有耐热芽孢菌。加上原料在贮运、加工过程中受到外来污染，大大增加了混合料中的细菌数。虽然经过高温杀菌，但不能完全将细菌，并且污染越严重，杀菌越困难，残留在混合原料中的细菌就多。
2、设备污染 由于设备在投产前未能很好消毒，特别是在混合物料经杀菌后与设备密切接触，如果消毒不彻底，将可能造成产品微生物超标。
3、操作人员的污染 冰淇淋生产中的细菌数与操作人员的个人卫生好坏有密切关系，进入操作间时不消毒，工作服等不消毒，不按卫生要求操作，都会把细菌带入生产车间。
4、空气污染 含菌的空气二次污染冰激凌，而原采用的臭氧、紫外线等也不能同步开机使用。
5、包装的污染 包装材料在加工储运过程中一般不是十分卫生的，易被细菌污染。所以除将包装物妥善保管外，还必须在使用前经过严格的杀菌消毒。
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