厚皮甜瓜的整枝方式很多，应根据品种、栽培方式、土壤肥力、留瓜多少而定，常见的方式有：
单蔓式，即主蔓不摘心，摘除坐瓜部位前的所有子蔓，选留10节以上中部的子蔓结瓜，瓜前留 2～3 叶对子蔓摘心，上部的子蔓根据田间生长情况可以放任生长、适时摘心或酌情疏除。
双蔓整枝，主蔓 3～4片真叶时摘心，子蔓15cm选留2条强壮的子蔓，其余从基部摘除。子蔓长到20～25节时摘心，子蔓4节以上留瓜，孙蔓留2叶摘心，结瓜后，子蔓上部的孙蔓可以放任生长，如植株生长势过旺，田间郁闭，可疏除部分不结瓜的孙蔓。
三蔓整枝，子蔓较多，田间叶面积指数增加快，坐果节位多，坐瓜早而整齐，有利于早熟，对子蔓、孙蔓都能坐瓜的早熟品种，早熟栽培的主蔓3～4片真叶时摘心，选留3条强壮的子蔓，6～8叶摘心，子蔓每节都能长孙蔓，绝大多数孙蔓第1、2节都能生雌花结瓜，但以子蔓上第3、4蔓的瓜发育较好，且较早熟，为了防止因孙蔓迅速生长争夺养分，影响坐瓜，在雌花开放前2天留2片叶对孙蔓摘心，如枝叶生长过旺也可酌情疏除下部不结果的孙蔓。
此外，还有四蔓式、六蔓式和多蔓式，但在露地早熟栽培中不大适用。
二、厚皮甜瓜的整枝注意事项
整枝应结合理蔓，使枝叶合理、均匀分布，以充分利用土地，减少茎叶重叠郁闭，否则不仅影响光合作用，而且易发病。
整枝应掌握前紧后松的原则。子蔓迅速伸长期必须及时整枝，孙蔓发生后抓紧理蔓、摘心，促进坐果，同时酌情疏蔓，促使植株从营养生长为主向生殖生长过渡，促果实生长。果实膨大后根据生长势摘心、疏蔓或放任生长。前期抓紧整枝，早熟效果显著，否则，茎蔓很快缠绕难分主次，致使坐果不及时，反过来又加快茎叶徒长，不仅增加整枝工作量，而且造成晚熟减产。在春季多风地区，应结合整枝用土块等压蔓。
整枝应在晴天中午、下午气温较高时进行，伤口愈合快，减少病菌感染；同时茎叶较柔软，可避免不必要的损伤。
整枝摘下的茎叶应随时收集带出瓜地。
有露水或阴雨不应整枝。
单株叶太少，整枝过狠，植株容易早衰，果实不能充分长大，含糖量也低，过早摘除所有生长点的“省工整枝”并不合理。实践证明，坐果后子蔓先端 1～2 孙蔓放任生长对防止植株早衰有利；尤其在干旱、瘠薄的地块，叶小株丛小，整枝更不应过狠。