（1）混料部分
混料部分是将含水率80%的污泥等有机废弃物与回流物料或调理机、高温生物发酵菌按照一定比例在混料机内进行充分混合，达到发酵条件。畜禽粪便等有机废物可直接发酵。
混料的目的主要是通过混料达到高温好氧发酵条件，并能够使物料具有良好的通透性。
（2）高温好氧发酵部分
该过程可分为快速升温阶段、高温阶段、降温阶段。物料进入发酵室内，在1-2天内快速分解，释放的热量使物料温度快速升高，温度一般为50～65℃。最高可达到80℃。通过送风系统向发酵室内均匀送氧，满足发酵过程氧气量需求，使物料充分发酵分解，高温阶段维持5-7天。当分解速度缓慢下降时，温度逐渐降低。整个发酵过程持续9-10天。温度升高与通风充氧加快物料水分的蒸发，从而减少物料体积，达到物料的减量化、稳定化的处理目的；
发酵室温度在50℃以上维持5～7天，可以较好的杀灭虫卵、病原菌和杂草种子。符合国家《畜禽粪便无害化标准》（gb7959-87）处理要求，达到污泥无害化处理的目的 。
(3)自动收料部分
发酵室内的污泥在主轴翻拌以及重力作用下逐层下落，发酵完毕后排出，发酵后的物料作为有机肥原料出售，实现资源化利用。
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