池塘常年不清洁有很多的危害：（1）沉积物水质恶化在养殖高峰期过后，池塘底部通常富含有机物质，如残留饵料、粪便以及动植物残留物。如果池塘一年四季不清洁，底部富含有机物，分解和转化将不可避免地消耗大量溶解氧。溶解氧低的环境很容易导致池塘底部氨氮和亚硝酸盐等有毒还原性物质浓度超标，从而导致底质恶化，影响水质，不利于下一轮养殖。（2）致病微生物的繁殖池塘是繁殖动物生活和居住的地方，也是各种病原体的藏身之处。经过一年的养殖，各种病原微生物通过不同的渠道进入池塘，池塘底部的污泥为养殖提供了合适的场所，导致大量的病原细菌滋生，容易引发鱼类疾病。
（3）降低池塘负荷不清理的池塘的长期养殖容易导致池塘底部淤泥过厚，导致池塘变浅，水承载能力降低，鱼类活动空间变小，产量降低。除了养鱼之外，池塘还经常混合野生杂鱼、虾和各种生物，如蜗牛、贻贝和水生昆虫，它们经常与养鱼争夺空间和抢食。甚至一些物种本身也会让鱼生病，而另一些是病原体的载体，对养殖鱼的正常生存和繁殖构成威胁。
清理池塘的工作一定要到位才可以呢，良好的底层环境对养殖是很重要的。大量养殖者在实际生产实践中总结出的“干池塘、净池塘和晒黑池塘”是更直接和更有针对性的改变底部的工作。（1）冬天，鱼离开池塘后，排出池塘的水，用挖掘机清理淤泥，并保留10 - 20厘米厚的淤泥作为“耕层”，以利于肥料、水和草的种植。池塘底部的污泥太厚，浪费空间，导致大量病原体和高酸化。如果淤泥太浅，很容易导致底部不稳定，很难用水施肥。
（2）在干燥的池塘中脱硅后，池塘被阳光照射，以利于紫外线消毒和在阳光下杀菌，池塘底部的有机物完全暴露在空气中，去氧化大部分的物质，好补上养殖的过程中欠下的氧气。根据天气和池塘底部的条件，干燥大约15 - 30天会在底部泥浆表面造成大量2 - 3厘米的裂缝，泥浆会被漂白成白色或黄色。人们最好在泥地上行走，看脚印不会漏水。如果你不放心，你也可以挖20厘米深的沉淀物，看看是否有黑色的污泥。如果有的话，这意味着有机物没有完全氧化，你需要继续沐浴在池塘里。
（3）清洁池塘消毒池塘完全干燥后，建议使用生石灰清理池塘。在向干洗池加水之前，需要在池底下挖几个小的坑，然后把生石灰( 60 - 75公斤/亩)倒入每个坑中，加入10 - 20厘米的水，生石灰融化成糊状后洒满整个池。第二天，整个池塘需要用泥耙来回耙，以充分发挥生石灰在清理池塘中的作用。
或者是湿法清理，是通过一次加入40 - 60厘米的水来清洁湿池塘，通常在船舱中加入生石灰( 100 - 150千克/微米)，加入适当的水趁着热的时候，全池子都撒上。