养殖废水处理流程是通过水驱动的全塑微滤机祛除水中固体颗粒，通过微生物池祛除氨氮，通过-沉淀池沉淀，通过-泡沫分离器祛除悬浮物及蛋白质，通过-高效溶氧装增氧，通过-紫外线杀菌，通过-调温和 ph 值调节后再进入养殖池循环使用。
水质监测系统可自动检测水的盐度，溶氧量，ph、温度做出相应的控制或报警，保证达到水产养殖需要。养殖池的气动定时排污阀利用养殖池水旋转聚污效应，定时将池中心聚集的粪便、残余饵料排掉，减轻水处理的负荷有效的保证水质。
系统运行成本高、使用寿命短
据近年来尝试工厂化养殖的用户反映，目前循环水养殖中系统运行的成本相对较高，主要表现在能耗上。由于国内使用的循环水系统大部分使用了微滤机等用电设备，导致系统运行中整体的能耗偏高，如何降低系统能耗成为很多欲从事循环水养殖人的诉求。
上世纪 80 年代，我国研究者从国外引进先进养殖设施，开展循环水养殖系统的研究。循环水养殖模式具有节水、节地、高效、环保的特点，在水产养殖的发展中越发显得重要。
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