研究人员发现,一种原癌基因编码蛋白myc往往受到snf5抑制。snf5的缺失相当于移除了myc“刹车”,从而加速了癌症的生长。
阻断myc在治疗mrt以及其他由snf5失活引起的癌症方面可能“出乎意料地有效”。
“治疗类似mrt这样的癌症的一个困难是,它被肿瘤细胞中一种特定蛋白质损失驱动,”研究人员说。
“如果myc是由snf5受损而激活,意味着它将是这些癌症的一个理想靶标,”他说。
myc家族有三个蛋白质成员,在美国每年因myc而死亡的癌症患者高达10万例。
myc蛋白作为转录调节因子发挥作用,控制与细胞生长、增殖、代谢和基因组不稳定相关的数千个基因的表达。实验室致力于确定myc工作的基本机制,从而在临床上针对myc制定新的策略。
在mrt细胞中,snf5抑制myc对靶基因的识别
首先怀疑在mrt背景下,snf5是否调节myc与染色质的相互作用,因为snf5丢失引起myc靶基因被反复激活。研究人员采用shrna介导的myc基因敲除(慢病毒shrna结构由赛业设计)mrt细胞,证实myc对mrt细胞的重要性,从而强化了snf5与myc对疾病的关联影响。接下来,再建立一个系统,比较相同环境下,在mrt细胞中重新引入snf5和抑制myc的效果。将chip与下一代测序(chipseq)结合,跟踪myc在g401细胞基因组中的分布,对比表达egfp的对照,研究人员发现了900个myc结合峰,进而比较omomyc或snf5表达的影响。结果显示,omomyc减少了可检测的全基因组myc结合,更重要的是,snf5也降低了myc结合,且snf5对myc结合的影响是全基因组性的,结合强度平均约降低了三倍,但myc稳态水平不受snf5表达影响,排除了结合减少由myc蛋白减少的可能性。
利用atac-seq、rna-seq和pro-seq,研究人员证明,snf5与myc的结合调节独立于snf5在染色质重塑中的作用,而是因为控制了rna聚合酶在myc调节基因处的暂停释放。snf5选择性地抑制myc与dna的结合,是其致瘤所必需的。
这些发现为mrt肿瘤发生提供了一个新模型,其中snf5的缺失使myc去阻遏,因此,将snf5重新导入mrt细胞可以将myc从染色质中置换出来,从而抑制原癌基因表达程序。
上海沪宇生物科技有限公司