学术上日语分为九州日语、关西日语、关东日语和八丈语四种方言。还可以细分为十三种方言：属于九州日语的萨隅方言、肥筑方言、丰日方言，属于关西日语的中国方言、云伯方言、四国方言、近畿方言、北陆方言，属于关东日语的东海东山方言、关东方言、内陆北海道方言、东北方言和沿岸北海道方言。日语的起源一直是争论不休的问题。明治时代的日本人把日语划为“阿尔泰语系”，后来遭到否定。美国人homer hulbert（1863—1949）和大野晋（1919—2008）认为日语属于达罗毗荼语系，西田龙雄（1928—2012）认为日语属于汉藏语系藏缅语族，美国人白桂思（1945—）认为日语属于日本-高句丽语系，即日语与隋唐时期分布于朝鲜半岛的高句丽语同源，俄罗斯人alexander vovin（1961—）认为，弥生人讲一种南亚语或侗台语。
三国时代，汉字传入日本，唐代时日本人发明了通行于女性之间的假名，官文为文言文，因此现代日本语受古代汉语影响极大。以昭和31年（1956年）的《例解国语辞典》为例，在日本语的语汇中，和语占36.6%、汉语占53.6%，昭和39年（1964年）日本国立研究所对90种杂志用语进行了调查研究，得出了和语占36.7%、汉语占47.5%、西洋语占近10%的结论。
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