不管是进口水性油墨还是国产水性油墨，印刷性能和质量都达不到溶剂性凹版油墨的标准。目前水性油墨都存在不抗碱、不抗乙醇和水、干燥慢、光泽度差、易造成纸张收缩等弊端。这主要是由于水的表面张力较高(72达因／厘米)，导致油墨难润湿，干燥缓慢。为了使水性油墨能在凹版印刷机中使用，不但油墨和树脂需要先进的技术，而且凹印设备也需要改进。
例如，将槽深大约38ixm—42ixm的蚀刻滚筒改变为槽深大约24ixm～28txm的激光制版滚筒，还需要更有效、更强力的干燥设备和用耐腐蚀材料制造的滚筒、泵和刮刀等组件。因所有这些需要大量的tou资，所以现在水性凹版油墨仍没有在欧洲和美国大量普及。水墨在聚乙烯等基材上难以很好地润湿和印刷干燥时间仍是水墨应用中最重要的问题，除非印刷机配有足够的干燥设备，否则印刷速度会因此而受影响；水墨光泽性低于溶剂型油墨，大大限制了水墨在光泽度要求高的场合的使用。
由于水性凹版油墨还不能够全面替代甲苯类油墨，所以油墨工业一直在努力开发易被环境接受的醇溶油墨。醇溶油墨能够帮助我们解决甲苯类油墨对健康所产生的伤害和溶剂残留影响包装食品质量等问题。在欧洲和美国，这种发展已成为一种趋势。要达到抗碱、抗乙醇、抗水和提高光泽度，只有采用柔性版uv油墨。而这样不仅提高了印刷成本，且增加了印刷工序，如有的啤酒包装半自动生产线，使用含碱性的润滑剂，其ph值为9—10，水性油墨承受不了，碰上就掉色。还有夏天南方销售啤酒时不仅要进冰箱，有的还在冰水中长期浸泡，水性油墨则承受不了。
水墨粘度过高、ph值偏低、印刷速度较快和印刷技术人员加水过多， 都容易产生气泡。气泡比较 大时会出现印刷品露白、上墨量少等现象，严重影响印刷质量。一般建议在水墨中 加抑泡剂和表面消泡剂两种混合使用，以解决水墨起泡现象，其使用比例为1~2%.
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