这种情况多数是由于加载项不兼容引起的，你试试在开始--搜索框中输入“无加载项”，然后启动那个无加载项的ie，如果正常使用，那就把普通模式中的ie加载项逐个禁用看看，禁用的方法：打开ie9--设置（alt+x）--管理加载项--工具栏和扩展，把里面的加载项逐个禁用试试。
另外也有可能是gpu加速功能导致的，尝试升级显卡驱动，或者关闭gpu加速功能，步骤：打开ie9设置（alt+x）--internet选项--高级，找到加速的图形，把下面的“使用软件呈现而不使用gpu呈现”打上勾，然后重启ie
实话说吧，ie9还不是非常稳定，建议卸载使用ie8吧，等ie9且是稳定以后再使用吧