水溶肥的特性决定了施用方式必须采用精确施肥。即将水溶肥按作物阶段营养的需求规律，适时适量地供应给作物。如果供应不够可能降低产量品质，而如果供应过量，那风险性会很大，轻者降低产品品质、无谓提高了成本，重者引起农田次生盐渍化而导致土壤质量下降等严重后果。当前从农民消费者到基层农技人员对水溶肥的特征与施用技术，在认识上还不够全面，施用方法也偏于粗放，也有一些企业出于对商业利润的过分追求，向消费者作一些不适当的推荐，例如向农民推荐一次冲施肥用25公斤硝xiao酸铵、20公斤硫liu酸钾等。一旦农民按这样的过量方式长期施下来，就会造成利用率低。
水溶肥的物理特性是溶解度高和溶解快。对于作物的营养特点：一是肥效快；二是水肥一体化供应。施肥和灌水捆绑在一起，这二者是相互影响的，既可能相互促进又可能相互制约，要更多地依赖人为协调才有效果。所以，水溶肥的施用技术较常规肥复杂，从根部供应叫灌溉施肥，从根外供应叫叶面施肥；采用不同灌溉方式施肥，对肥料的成分与质量要求不同，应该合理配套使用。