蜡状芽孢杆菌对cd、pb、cr等重金属具有较强的抗性，可通过静电吸附、离子交换作用、表面络合作用吸附水相中重金属。但蜡状芽孢杆菌用于土壤重金属修复的实例相关报道还不多见。胡永娟利用蜡状芽孢杆菌修复麦田cr，结果表明小麦幼苗叶和根系cr含量分别下降8.87%～24.67% ；当蜡状芽孢杆菌与米根霉联用时，可使小麦地上部和地下部cr含量分别降低42.15%～46.91% 和26.11%～48.24%，土壤有效态cr含量下降2.1%～9.0%，说明蜡状芽孢杆菌在修复土壤重金属污染方面的应用是具备一定潜力的。目前有关蜡状芽孢杆菌对土壤cd的修复的实例还比较少，但由于蜡状芽孢杆菌对cd具有极强的抗性，且对cd的吸附效果好，使其在土壤cd污染修复方面的应用具有较大的研究价值。
微生物肥料是土壤的“清洁师”。微生物在其繁殖和代谢过程中，可以降解土壤中残留的化肥、重金属和其他污染物等，在其理化反应中对上述污染物质进行分解、转化、固定、转移以及新的无害化合成，把他们分解成低害甚至无害的物质，从而降低土壤污染的程度。微生物肥料是土壤的“师”。土壤中的微生物，例如抗生性微生物，它们能够分泌，抑制病原微生物的繁殖，这样就可以防治和减少土壤中土传病害微生物对作物的危害，提高作物产量和品质。对土壤进行“保健”，调控和维护土壤的健康质量。
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