空气中的湿度和水分对于配合饲料的贮存起着重要的作用，配合饲料的水分一般要求在12%以下，如果空气中的湿度过高，导致配合饲料中的水分超过了这个比例，再遇夏季高温，极易霉变。因此，配合饲料在高温期间的贮藏要保持干燥，包装要用双层袋，除外面用纺织袋包装以外，里面还要有一层不透气的塑料袋，这样才能阻止空气中水分的渗入。为了防潮，配合饲料在存放时还应离地面30厘米以上，而且不能靠墙，地面要铺秸秆、稻壳一类的防潮物，上面再铺上一层草席，后堆放配合饲料才比较安全。
水产配合饲料有粉状，颗粒状，颗粒状又有软颗粒，硬颗粒，膨化颗粒。选择哪一种要看养殖对象的食性、摄食分式等特点，如鳗鲡料，属于粉状，粉料吸水后做成团状利于鳗鲡的摄食，但现在向驯食膨化颗粒料方向发展。现在鱼料多数是颗粒料，颗粒料优于粉料，适应于水中投喂，在水中营养损失小于粉料，同时降低水质的污染。
在生产颗粒料时，冷却器出现异常，导致饲料温度较高，因温差大而使其发霉(饲料厂打包时要求饲料与环境温差不超过3℃，因此可以避免此类情况的发生)。冷却器出现异常还会直接导致饲料水分高(饲料水分检测作为出场检验的必检指标，一般不会发生)。其次，在饲料制粒过程中，提升料斗和管道中积存的物料可形成霉块，脱落后进入城品仓和包装袋，引起整包饲料发霉。这种情况发生的比例很少，不会导致成批饲料发霉。

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