温度对配合饲料的保管和贮存影响很大，因为配合饲料里存在营养物质和少量水分，为细菌的生存、繁殖提供了有利条件，高温下细菌体内酶的活性有1定程度提高,细菌活动性增强,大量繁殖,使配合饲料中的组成成分迅速分解，以致腐败变质，产生大量的有害物质，水产养殖动物吃了霉变的饲料，不仅会影响其正常生长，长期以往，有毒有害物质在水产养殖动物体内蓄积，后还会殃及消费者的身体健康。当温度低于10℃时，霉菌生长缓慢，高于30℃则生长迅速，配合饲料会迅速变质，因此，高温期间配合饲料应贮存在低温通风处。贮存饲料的库房应具有隔热、避光、防辐射等性能，因而库顶要有隔热层，周围种树遮荫，墙壁还要涂上白色以减少热量的吸收。
梅雨季节，气候潮湿，又随着气温升高，为饲料霉变创造了条件。饲料霉变轻者造成饲料适口性降低，导致水产动物食欲减退，生长缓慢，重者导致水产动物体内毒物残留，造成中毒死亡。因此，饲料霉变必须加以重视，有效管理好水产饲料至关重要。饲料中霉菌毒素对畜禽的危害主要表现在，生长迟缓、黄疸、抑郁、厌食、被毛粗乱、肝肾损伤、免疫抑制、受精率低、饲料转化率低等方面。畜禽食用了霉变的饲料，会在肉蛋奶中有残留，通过食物链对人体健康造成危害，导致畸形、ai变、免疫抑制等。
各种饲料原料都是有特定的气味和滋味，如水产饲料中添加的鱼粉是有正常的鱼腥味，如果饲料用了一些鱼粉的替代品，这种鱼腥味就比较淡，甚至干脆就没有。另外，较差的饲料有可能出现没味甚至出现常说的哈拉味，这表明饲料中的脂肪发生了氧化，投喂这种饲料有可能引起鱼的大面积死亡，并污染水质。这类饲料不能购买。

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